主人公である有馬たくやは幼少期に母を亡くし、歴史学者である父も二ヶ月前に事故で亡くしてしまった。すべてにおいて活力を失ってしまった高校生活最後の夏休み。ある日、用途不明の丸い鏡とガラス玉のはまった妙な物体が入った小包が届けられる。同梱されていた手紙には父親が生きていると思わせる内容が…？！ 「今夜10時に、この物体を持って剣ノ岬（三角山）へ行け」 指示に従いその場へ向かうと、謎の女性が倒れていた。そこには学園長と謎の転校生の姿も。瞬間、地響きとともに光に包まれる…。 並列世界を駆け巡る旅が、今、始まる！

大人と呼ぶには幼くでも自分たちはもう子供 ではないと思っている高校生。 ある日を境に音楽から離れた坂井和奏。 歌うことを諦めきれない宮本来夏。 親友のために力を貸す沖田紗羽。 笑ったり喧嘩したり悩んだり恋をした り・・・・・・。 ありふれた日常を送りつつ、少しずつ少しず つ前に進む少女達。 時には回り道をしながら、ひとりでは無理か もしれないけれど 親友がいればいつかきっと--。 和奏、来夏、紗羽そして彼女達の奏でるアン サンブルが、音楽の力が 小さくも煌びやかな物語を紡ぎ出す。 高校生活最後の夏。 それは夢を諦めるにはまだ少し早い季節。 江ノ島に響く歌声が今日も僕らを勇気付ける。

「さぁ、始めようか―― 新しい神話を　可憐な戦記を　奇跡の恋物語を――」2020年、新東帝都にそびえ立つビルの屋上で、一人の男がそう宣言した。それは「鶺鴒計画」の始まりを告げる合図。"セキレイ"と呼ばれる108羽の可憐な戦士たちは、自らの主・葦牙(アシカビ)を求めて人の世へと放たれた――――自らの想いを賭けて、最後の一羽と成る為に。「ごめん、今年もダメだった・・・」憧れの都会に上京したものの、大学受験に失敗したさえない浪人生・佐橋皆人。彼は、やりたい事も無く・親しい友人もおらず・ましてや彼女なんているわけもない、いわゆるヘタレ。 しかもその日、２浪が決定したばかりだった。厳しい現実に、落ち込みながら帰路に付く皆人。 そんな彼の前に、突然、空から謎の美少女が降ってきた。彼女の名は"結"。自らを"セキレイ"と名乗る彼女は、運命の相手"葦牙"として皆人を選んだのだった。「私、皆人さんのために闘います！」そして皆人と結の絆が刻まれたとき、物語は動き始める―― これは、人とセキレイが織り成す、新しい神話 これは、セキレイ達が繰り広げる、可憐な戦記 これは、運命の相手と紡ぎ出す、奇跡の恋物語。 全ては、愛する者と永遠に婚ぐ為に――――――